《薔薇少女 ~序曲~》作为TV动画的特別篇于2006年12月22、23日深夜播出,主角是水銀燈和真红,介绍两人从最初相遇到反目成仇的过程。共前、後兩篇。
故事发生在名为鹿缟的城市中。因为同暗恋的女生神泉安菜(堀江由衣 配音)告白被拒绝,平凡的少年大佛弹(植田佳奈 配音)决定前往鹿缟山换换心情。没想到,这居然成为了改变大佛弹一生的一趟旅途。目击到外星飞船
一日,致力于研究化学X神秘物质的ユートニウム博士跟助手同时也是他儿子肯发现了一种新物质Z。这种物质发射出一道白光跟一道黑光,在东京城中放出。这道白光打到了初中一年级生赤堤ももこ、豪徳寺みやこ、松原かお